Em maio de 2025, uma funcionária do advogado Willer Tomás solicitou ao banco que Flávio Bolsonaro fosse desvinculado de uma conta da Holdings, que ele usava. A solicitação veio após a Polícia Federal obter mensagens que indicavam que o senador era usuário master da conta da Holdings no Santander. O advogado Willer Tomás também é sócio da Holdings. A defesa de Flávio argumenta que ele não teve intenção de ocultar informações e que a quebra dos sigilos é desnecessária.

