O uso indiscriminado de fertilizantes e agrotóxicos na agropecuária causa prejuízo ao meio ambiente, com resquícios desses produtos atingindo rios e afetando a qualidade da água de algumas cidades brasileiras. Uma pesquisa da Embrapa mapeou as regiões mais afetadas no país, evidenciando a necessidade de monitoramento em municípios como Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Goiás, e na região do Mato Piba. A pesquisa destaca os riscos associados ao nitrogênio e ao fósforo, elementos usados nos fertilizantes, que podem comprometer a qualidade da água e gerar prejuízos econômicos.

