A transposição do Rio São Francisco, prometida por Lula até 2009 e repetidamente adiada, não foi concluída durante o governo Bolsonaro. A obra, dividida em etapas e eixos leste e norte, com o objetivo de levar água a diferentes estados, não atingiu a conclusão em 2009, como sugeriu Flávio Bolsonaro. O TCU destaca que a obra possui diversas etapas e que o avanço de um eixo não implica a conclusão total.

